O jogo usa as regras originais do jogo de cartas com algumas
modificações. Os jogadores têm 4000 Pontos de Vida, a Fase Principal 2 é
removida, o número de lugares de monstros e feitiços é reduzido e os
personagens podem ter habilidades que afetam o jogo. Os conjuntos de
cartas são os primeiros lançados ao redor do tempo do anime Yu-Gi-Oh! Duel Monsters. Como os jogadores ganham duelos e o nível cresce, eles recebem uma
variedade de recompensas, incluindo novas cartas, moedas, pedras
preciosas e pedras. Moedas e pedras podem ser trocadas por novass cartas
através do comerciante, enquanto as jóias podem ser usadas para comprar
novos cartas na loja. O jogo também inclui um modo PvP
onde os jogadores podem duelar em tempo real com amigos, assim como
participar de duelos aleatórios com jogadores de todo o mundo. Eventos especiais ocorrem por um período limitado de tempo para
fornecer variedade e a oportunidade de ganhar cartas raras. O primeiro
desses eventos foi a aparição de Yugi Muto (separado de Yami Yugi) que
proporcionou a oportunidade de ganhar cartas raras como Gandora, o
Dragão da Destruição. O próximo evento foi Toon World com a oportunidade
de desbloquear Maximillion Pegasus e seus monstros Toon. No entanto, o evento Toon World foi atrasado devido a problemas do servidor.
